RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 DGKIO75912 1065 aa26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 PPFIA1Q13136 1202 aa26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa26.55■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 KCNA2P16389 499 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CAMK1Q14012 370 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CLUL1Q15846 466 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 GRIK4Q16099 956 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 MAP4K1Q92918 833 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CUL5Q93034 780 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 P2RX5Q93086 422 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 GPRASP2Q96D09 838 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 MAP3K14Q99558 947 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.54■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 ATP9AO75110 1047 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 NCOA7Q8NI08 942 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CDHR1Q96JP9 859 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 MUTYHQ9UIF7 546 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CD207Q9UJ71 328 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.53■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 REC8O95072 547 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 SMARCA1P28370 1054 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 ADAM15Q13444 863 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 SQORQ9Y6N5 450 aa26.52■■□□□ 1.84
SIMC1-208ENST00000495423 E7EWF7 191 aa26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 LINC01565O15544 149 aa26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 PTH1RQ03431 593 aa26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 RNF135Q8IUD6 432 aa26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 MSLNLQ96KJ4 702 aa26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 KMT2EQ8IZD2 1858 aa26.51■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 EVPLQ92817 2033 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 STXBP3O00186 592 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 EYA4O95677 639 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 ANTXR2P58335 489 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 IGFLR1Q9H665 355 aa26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 ITGB5P18084 799 aa26.49■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 MARK3P27448 753 aa26.49■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 EDAQ92838 391 aa26.49■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 DDAH1O94760 285 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJB1P25685 340 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 CD52P31358 61 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 KIF5BP33176 963 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 SPPL3Q8TCT6 385 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 GLG1Q92896 1179 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.48■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 CACNA1HO95180 2353 aa26.47■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.47■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 ITGB1P05556 798 aa26.47■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 NDUFV1P49821 464 aa26.47■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 IER5Q5VY09 327 aa26.47■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa26.47■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 EFHBQ8N7U6 833 aa26.47■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 COASYQ13057 564 aa26.46■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 MTMR1Q13613 665 aa26.46■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 SMRP1Q8NCR6 262 aa26.46■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.46■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 LY9Q9HBG7 655 aa26.46■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 CLEC1BQ9P126 229 aa26.46■■□□□ 1.83
SIMC1-208ENST00000495423 MAFGO15525 162 aa26.45■■□□□ 1.82
SIMC1-208ENST00000495423 CSPG5O95196 566 aa26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms