RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	19.65	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TLL1	O43897	1013 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKL5	O76039	1030 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	AR	P10275	920 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	RABGGTB	P53611	331 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	AK2	P54819	239 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTR2	P61160	394 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	RABEP1	Q15276	862 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIK4	Q16099	956 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		19.64	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ST18	O60284	1047 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	DEXI	O95424	95 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	CA3	P07451	260 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	STAT5B	P51692	787 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SP4	Q02446	784 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	NME8	Q8N427	588 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	USP38	Q8NB14	1042 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PHKB	Q93100	1093 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PCYT2	Q99447	389 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	INSL6	Q9Y581	213 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRS	Q13332	1948 aa		19.63	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM86B1	E9PN63	330 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	AMH	P03971	560 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TAP1	Q03518	808 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	STK3	Q13188	491 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM260	Q9NX78	707 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		19.62	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	INSRR	P14616	1297 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT76	Q01546	638 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	EYS	Q5T1H1	3165 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT6A	Q92794	2004 aa		19.61	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	COL1A2	P08123	1366 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	HBP1	O60381	514 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOG	P15173	224 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRE1	Q14246	886 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCB4	Q15147	1175 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	IER5	Q5VY09	327 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TOP1MT	Q969P6	601 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PGBD1	Q96JS3	809 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	RIT2	Q99578	217 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		19.6	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEB3	A0JP26	581 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PFKFB2	O60825	505 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNA1	P02708	482 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP5	P59047	1200 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAT3	Q09327	533 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEB	Q6S5H4	581 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD11	Q96NU1	681 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		19.58	■□□□□ 0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNE2	O96020	404 aa		19.58	■□□□□ 0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP3A7	P24462	503 aa		19.58	■□□□□ 0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-21	P61565	698 aa		19.58	■□□□□ 0.72

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