RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.95□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.95□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.95□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.95□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 IER2Q9BTL4 223 aa4.95□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 CD244Q9BZW8 370 aa4.95□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.94□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 MATN2O00339 956 aa4.93□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.93□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 AGAP2Q99490 1192 aa4.93□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.93□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.93□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 FSTL1Q12841 308 aa4.92□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.92□□□□□ -1.62
SENP6-210ENST00000487548 KCTD1Q719H9 257 aa4.92□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.92□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.92□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 TTPALQ9BTX7 342 aa4.91□□□□□ -1.62
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SENP6-210ENST00000487548 ETV4P43268 484 aa4.9□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 DUSP8Q13202 625 aa4.9□□□□□ -1.63
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SENP6-210ENST00000487548 KIZQ2M2Z5 673 aa4.9□□□□□ -1.63
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SENP6-210ENST00000487548 D2HGDHQ8N465 521 aa4.9□□□□□ -1.63
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SENP6-210ENST00000487548 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.9□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.9□□□□□ -1.63
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SENP6-210ENST00000487548 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.89□□□□□ -1.63
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SENP6-210ENST00000487548 LBX2Q6XYB7 198 aa4.89□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.89□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.89□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 SCYL1Q96KG9 808 aa4.89□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 PCSK5Q92824 1860 aa4.88□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 PRODHO43272 600 aa4.88□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 RPS6KA4O75676 772 aa4.88□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 GJB6O95452 261 aa4.88□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 SOD2P04179 222 aa4.88□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 BMP5P22003 454 aa4.88□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 GRM7Q14831 915 aa4.88□□□□□ -1.63
SENP6-210ENST00000487548 TNNI3KQ59H18 835 aa4.88□□□□□ -1.63
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