RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 CCDC103Q8IW40 242 aa5.34□□□□□ -1.55
PHC3-211ENST00000486042 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.34□□□□□ -1.55
PHC3-211ENST00000486042 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.34□□□□□ -1.55
PHC3-211ENST00000486042 MKL1Q969V6 931 aa5.34□□□□□ -1.55
PHC3-211ENST00000486042 RBPJLQ9UBG7 517 aa5.34□□□□□ -1.55
PHC3-211ENST00000486042 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.34□□□□□ -1.55
PHC3-211ENST00000486042 ARNTLO00327 626 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 NAT2P11245 290 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 LSAMPQ13449 338 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 TESK1Q15569 626 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 NFE2L2Q16236 605 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 PPP2R5EQ16537 467 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 VHLLQ6RSH7 139 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 MSL2Q9HCI7 577 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 KCND1Q9NSA2 647 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CKMP06732 381 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 FXNQ16595 210 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 DDR2Q16832 855 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CCDC142Q17RM4 750 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ZNF627Q7L945 461 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ST7Q9NRC1 585 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.32□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 H0Y858 1186 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 KRIT1O00522 736 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 HOXC12P31275 282 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 PHF19Q5T6S3 580 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CCDC113Q9H0I3 377 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.31□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CUTAO60888 179 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 IL12RB1P42701 662 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 DUSP8Q13202 625 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 RASA3Q14644 834 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 STPG3Q8N7X2 389 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CLDND1Q9NY35 253 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 SNTG2Q9NY99 539 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.3□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 TLDC2A0PJX2 215 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CDC14BO60729 498 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 DDAH1O94760 285 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 GJB6O95452 261 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 PEX11BO96011 259 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 SCG5P05408 212 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 COL10A1Q03692 680 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 NCAPHQ15003 741 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 RNF151Q2KHN1 245 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CCDC140Q96MF4 163 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 OR14A2Q96R54 314 aa5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 B2RBV5 119 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 FOXN1O15353 648 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CPP00450 1065 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 KRT4P19013 534 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 POLD1P28340 1107 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 LTBRP36941 435 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 TBX22Q9Y458 520 aa5.28□□□□□ -1.56
PHC3-211ENST00000486042 TMEM191CA6NGB0 347 aa5.27□□□□□ -1.57
PHC3-211ENST00000486042 PDPK1O15530 556 aa5.27□□□□□ -1.57
PHC3-211ENST00000486042 FAHP16930 419 aa5.27□□□□□ -1.57
PHC3-211ENST00000486042 BMP5P22003 454 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms