RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 PPFIA1Q13136 1202 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 USP17L6PQ6QN14 398 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SKAP1Q86WV1 359 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CFAP54Q96N23 3096 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 TROAPQ12815 778 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 WTAPQ15007 396 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PCNX4Q63HM2 1172 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 RSPH3Q86UC2 560 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF135Q8IUD6 432 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CUL5Q93034 780 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNH6Q9H252 994 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CD207Q9UJ71 328 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 STXBP3O00186 592 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MMP1P03956 469 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP21A2P08686 494 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 GRIK4Q16099 956 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 NLRX1Q86UT6 975 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PKD2L1Q9P0L9 805 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PLAGL2Q9UPG8 496 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP9AO75110 1047 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 DGKIO75912 1065 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PTMSP20962 102 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CD52P31358 61 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFV1P49821 464 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 IGBP1P78318 339 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CAMK1Q14012 370 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 XRRA1Q6P2D8 792 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 GLG1Q92896 1179 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PLVAPQ9BX97 442 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 FSD2A1L4K1 749 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MEIS2O14770 477 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNA2P16389 499 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAJB1P25685 340 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PTH1RQ03431 593 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ADAM15Q13444 863 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SEPT1Q8WYJ6 367 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 EVPLQ92817 2033 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 E7EWF7 191 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ITGB1P05556 798 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 NCOA7Q8NI08 942 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 GPRASP2Q96D09 838 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MSLNLQ96KJ4 702 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MYL10Q9BUA6 226 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PIK3CDO00329 1044 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ITGB5P18084 799 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ANTXR2P58335 489 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 KLHL23Q8NBE8 558 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SPPL3Q8TCT6 385 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 EDAQ92838 391 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 P2RX5Q93086 422 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CDHR1Q96JP9 859 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SPZ1Q9BXG8 430 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 CLEC1BQ9P126 229 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-207ENST00000484547 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms