RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480940.1

PHF20-210, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-210ENST00000480940 STAT3P40763 770 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 DSG1Q02413 1049 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ADAM9Q13443 819 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CD276Q5ZPR3 534 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 PWWP2AQ96N64 755 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.56□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 RASSF10A6NK89 507 aa5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 RTP5Q14D33 572 aa5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ZNF385BQ569K4 471 aa5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ZNF839A8K0R7 811 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 RFXAPO00287 272 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 HIP1RO75146 1068 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 MMEP08473 750 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 PFKPQ01813 784 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 VWA3BQ502W6 1294 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 VASNQ6EMK4 673 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 TTLL6Q8N841 843 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 DTX3Q8N9I9 347 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 KYQ8NBH2 561 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 TMEM209Q96SK2 561 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 OXSMQ9NWU1 459 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 BTBD7Q9P203 1132 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 H7C1D1 291 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 FFAR3O14843 346 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 FOXP2O15409 715 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 NUAK1O60285 661 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 GAS7O60861 476 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 DNAJC6O75061 913 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CFPP27918 469 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 AOAHP28039 575 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SDHAP31040 664 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SOX5P35711 763 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SCNN1BP51168 640 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 KIF11P52732 1056 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 HERVK_113P62684 666 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CAP1Q01518 475 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 PHF19Q5T6S3 580 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 C1QL4Q86Z23 238 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ASB15Q8WXK1 588 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 IFT57Q9NWB7 429 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-210ENST00000480940 DBX1A6NMT0 343 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 SLC9A1P19634 815 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 MC4RP32245 332 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 DHCR24Q15392 516 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 CLIC6Q96NY7 704 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 GBP4Q96PP9 640 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 TMX1Q9H3N1 280 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 SPC25Q9HBM1 224 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 DLL4Q9NR61 685 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 A0A1B0GTL3 188 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 TGM5O43548 720 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 MPIG6BO95866 241 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 BPIP17213 487 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-210ENST00000480940 PTGS1P23219 599 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms