RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478911.1

SUPT20H-215, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, human

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 591 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUPT20H-215	ENST00000478911	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	NFIX	Q14938	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	NR1I3	Q14994	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SCD	O00767	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	HIP1R	O75146	1068 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	LTF	P02788	710 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	GJA4	P35212	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SEC23A	Q15436	765 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	CPZ	Q66K79	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	DLG3	Q92796	817 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	TGM5	O43548	720 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KATNA1	O75449	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PDE6B	P35913	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PRR5	P85299	388 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	MTMR1	Q13613	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ZNF174	Q15697	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SLC9A1	P19634	815 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KIF11	P52732	1056 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	DLG4	P78352	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	GRIN1	Q05586	938 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUPT20H-215	ENST00000478911	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	ACOT7	O00154	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	HRK	O00198	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	ABLIM1	O14639	778 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	ULK1	O75385	1050 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	PRKD3	O94806	890 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	SDHA	P31040	664 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	SESN3	P58005	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	PHC1	P78364	1004 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUPT20H-215	ENST00000478911	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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