RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 GPR153Q6NV75 609 aa22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 HERVK_113Q902F9 699 aa22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 BACH1O14867 736 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SLC26A2P50443 739 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 FOSBP53539 338 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 LETM2Q2VYF4 491 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 RASIP1Q5U651 963 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 NEK8Q86SG6 692 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SLC5A5Q92911 643 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 MBOAT7Q96N66 472 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 RIT2Q99578 217 aa22.53■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 GAS7O60861 476 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SLC34A2O95436 690 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 MMP1P03956 469 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 THPOP40225 353 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 NR5A1Q13285 461 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 GRIK4Q16099 956 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 KRT40Q6A162 431 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TRPC6Q9Y210 931 aa22.52■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 PLCB4Q15147 1175 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 TNFRSF25Q93038 417 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 BACH2Q9BYV9 841 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF302Q9NR11 478 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 SAMM50Q9Y512 469 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 TET1Q8NFU7 2136 aa22.51■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 POTEB3A0JP26 581 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 BTBD18B2RXH4 712 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CAND2O75155 1236 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 PSAPP07602 524 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 ACTN1P12814 892 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 INSRRP14616 1297 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 POTEBQ6S5H4 581 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.5■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 WDR64B1ANS9 1081 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 SLC37A4O43826 429 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 IGBP1P78318 339 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 GPNMBQ14956 572 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 GJA10Q969M2 543 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 C8orf76Q96K31 380 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 FAM205CA6NFA0 338 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 NBNO60934 754 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 PSMD10O75832 226 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CXCL10P02778 98 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 RSPH10BP0C881 870 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 MCM2P49736 904 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 GUCY1B3Q02153 619 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 DISC1Q9NRI5 854 aa22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 ZBBXA8MT70 800 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CHMP2AO43633 222 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 HBP1O60381 514 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 SFNP31947 248 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 JAK3P52333 1124 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 MBTPS1Q14703 1052 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 TMX3Q96JJ7 454 aa22.47■■□□□ 1.19
CTPS1-206ENST00000470271 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.47■■□□□ 1.19
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