RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 CTNNB1P35222 781 aa25.94■■□□□ 1.74
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USP4-208ENST00000464168 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.94■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 MAFGO15525 162 aa25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 PCYT2Q99447 389 aa25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.93■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.92■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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USP4-208ENST00000464168 MUC6Q6W4X9 2439 aa25.92■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.91■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 GRM6O15303 877 aa25.91■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 INSRRP14616 1297 aa25.91■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 IGBP1P78318 339 aa25.91■■□□□ 1.74
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USP4-208ENST00000464168 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.91■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.91■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.91■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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USP4-208ENST00000464168 LTBRP36941 435 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.9■■□□□ 1.74
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USP4-208ENST00000464168 LMAN2LQ9H0V9 348 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 CLDND1Q9NY35 253 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 TTC3P53804 2025 aa25.9■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.89■■□□□ 1.74
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USP4-208ENST00000464168 CD52P31358 61 aa25.89■■□□□ 1.74
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USP4-208ENST00000464168 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.89■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 POTEBQ6S5H4 581 aa25.89■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.89■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.89■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.89■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 C5orf42Q9H799 3197 aa25.88■■□□□ 1.73
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USP4-208ENST00000464168 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.88■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 MICU3Q86XE3 530 aa25.88■■□□□ 1.73
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USP4-208ENST00000464168 ALADP13716 330 aa25.87■■□□□ 1.73
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USP4-208ENST00000464168 FAM50BQ9Y247 325 aa25.87■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 SQORQ9Y6N5 450 aa25.87■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 ARP10275 920 aa25.86■■□□□ 1.73
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USP4-208ENST00000464168 PLCB4Q15147 1175 aa25.86■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.86■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.86■■□□□ 1.73
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USP4-208ENST00000464168 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.86■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.86■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 TRPC6Q9Y210 931 aa25.86■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.86■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 TRIOO75962 3097 aa25.86■■□□□ 1.73
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USP4-208ENST00000464168 PADI3Q9ULW8 664 aa25.85■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.85■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.85■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.85■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 STAT5BP51692 787 aa25.84■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 FUT2Q10981 343 aa25.84■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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USP4-208ENST00000464168 APOA5Q6Q788 366 aa25.84■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.84■■□□□ 1.73
USP4-208ENST00000464168 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.84■■□□□ 1.73
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