RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 NEK8Q86SG6 692 aa23.49■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 LAMA3Q16787 3333 aa23.49■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 ADAM17P78536 824 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 NR5A1Q13285 461 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 GRIK4Q16099 956 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 LETM2Q2VYF4 491 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 KRT40Q6A162 431 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 HERVK_113Q902F9 699 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 VWCEQ96DN2 955 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 MBOAT7Q96N66 472 aa23.48■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 PLCB4Q15147 1175 aa23.47■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.47■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.47■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.47■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 ZNF302Q9NR11 478 aa23.47■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 GJA10Q969M2 543 aa23.46■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 SAMM50Q9Y512 469 aa23.46■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.46■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 INSRRP14616 1297 aa23.45■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 C8orf76Q96K31 380 aa23.45■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.44■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 PSMD10O75832 226 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 RSPH10BP0C881 870 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 GPNMBQ14956 572 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 TET1Q8NFU7 2136 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 DISC1Q9NRI5 854 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.42■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 WDR81Q562E7 1941 aa23.41■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.41■■□□□ 1.34
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VARS-218ENST00000459667 CXCL10P02778 98 aa23.41■■□□□ 1.34
VARS-218ENST00000459667 MBTPS1Q14703 1052 aa23.41■■□□□ 1.34
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