RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-210	ENST00000440825	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	FOSL2	P15408	326 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	ADAM17	P78536	824 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	TCTN1	Q2MV58	587 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	TBCK	Q8TEA7	893 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	CDH23	Q9H251	3354 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	LARGE1	O95461	756 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	INSRR	P14616	1297 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	PLCB4	Q15147	1175 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	CIITA	P33076	1130 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	IKBKE	Q14164	716 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	ME3	Q16798	604 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FAAP20-210	ENST00000440825	CAND2	O75155	1236 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	ATG7	O95352	703 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	XBP1	P17861	261 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	IL17RA	Q96F46	866 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	STK36	Q9NRP7	1315 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	POTEB3	A0JP26	581 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	CTDNEP1	O95476	244 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	USP11	P51784	963 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	DEFB103A	P81534	67 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	GALNT17	Q6IS24	598 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	POTEB	Q6S5H4	581 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	RSPH3	Q86UC2	560 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF302	Q9NR11	478 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	SAMM50	Q9Y512	469 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	KIF28P	B7ZC32	967 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	CA3	P07451	260 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	LENG9	Q96B70	501 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	EDIL3	O43854	480 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	31.41	■■■□□ 2.62	2e-6	■■■■□ 23.7
FAAP20-210	ENST00000440825	NPY5R	Q15761	445 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	C8orf34	Q49A92	452 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	GTF3C6	Q969F1	213 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825		M0R2N6	131 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	MSH4	O15457	936 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	CHMP2A	O43633	222 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	TLL1	O43897	1013 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	TDP2	O95551	362 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	KRT76	Q01546	638 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	SEPT8	Q92599	483 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	GJA10	Q969M2	543 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	EFCAB14	O75071	495 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC26A2	P50443	739 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	FOSB	P53539	338 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	INF2	Q27J81	1249 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	WASF1	Q92558	559 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FAAP20-210	ENST00000440825	PTPRS	Q13332	1948 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FAAP20-210	ENST00000440825	GAS7	O60861	476 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FAAP20-210	ENST00000440825	CHRNA1	P02708	482 aa		31.38	■■■□□ 2.61

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