RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428650.5

STRC-201, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 5,386 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-201ENST00000428650 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FAM187AA6NFU0 413 aa15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NAA35Q5VZE5 725 aa15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 JADE1Q6IE81 842 aa15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TCP11Q8WWU5 503 aa15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SCOCQ9UIL1 159 aa15.51■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PALLDQ8WX93 1383 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KRT10P13645 584 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 OSBPP22059 807 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ESRRGP62508 458 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 RASGRF1Q13972 1273 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TMED2Q15363 201 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FTCDO95954 541 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MYBL1P10243 752 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CDK8P49336 464 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SCNN1DP51172 638 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 RASIP1Q5U651 963 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CEP170P1Q96L14 293 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TLK1Q9UKI8 766 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MAP3K7O43318 606 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 LRRC41Q15345 812 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TRIM15Q9C019 465 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SNX25Q9H3E2 840 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GLI2P10070 1586 aa15.5■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MECOMQ03112 1051 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KCNB1Q14721 858 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CLGNO14967 610 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SPARCL1Q14515 664 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 RAD54LQ92698 747 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FAM167AQ96KS9 214 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 USP31Q70CQ4 1352 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PRPSAP2O60256 369 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PRKAB2O43741 272 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KRT37O76014 449 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GRM4Q14833 912 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 DTNBO60941 627 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ERFEQ4G0M1 354 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 HDAC11Q96DB2 347 aa15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CLTCL1P53675 1640 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 IFNAR2P48551 515 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TFDP2Q14188 446 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ARMCX2Q7L311 632 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KCTD6Q8NC69 237 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CALB1P05937 261 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PGBD1Q96JS3 809 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SERPINB2P05120 415 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 UIMC1Q96RL1 719 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ARL4CP56559 192 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ZBTB5O15062 677 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms