RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	NFASC	O94856	1347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM150B	A6NC51	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MEIS1	O00470	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MSH4	O15457	936 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	LGR5	O75473	907 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	THPO	P40225	353 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ADAM17	P78536	824 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PPFIA1	Q13136	1202 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	RABEP1	Q15276	862 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	GRIK4	Q16099	956 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	INF2	Q27J81	1249 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CYP3A4	P08684	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SELP	P16109	830 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ATP4A	P20648	1035 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF76	P36508	570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MGAT3	Q09327	533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PTK7	Q13308	1070 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	BFSP2	Q13515	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SDF4	Q9BRK5	362 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	GNA11	P29992	359 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CIITA	P33076	1130 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	GLG1	Q92896	1179 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	C5orf42	Q9H799	3197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MYO9B	Q13459	2157 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF862	O60290	1169 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	FGB	P02675	491 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CXCL10	P02778	98 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	GHR	P10912	638 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MCM2	P49736	904 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	LETM2	Q2VYF4	491 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	TIFA	Q96CG3	184 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55	3e-8	■■■■□ 24.2
HDLBP-216	ENST00000428482	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	BACH1	O14867	736 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CDKL5	O76039	1030 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	ATG7	O95352	703 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CA3	P07451	260 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	INSRR	P14616	1297 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	PRKCE	Q02156	737 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	11.59	□□□□□ -0.55	6e-7	■■■■□ 21.8
HDLBP-216	ENST00000428482	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDLBP-216	ENST00000428482	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55

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