RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LPIN1Q14693 890 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC96Q2M329 555 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLPP4Q5VZY2 271 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TBC1D17Q9HA65 648 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KCNK12Q9HB15 430 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STX8Q9UNK0 236 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYH4Q9Y623 1939 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WDR19Q8NEZ3 1342 aa10.07□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DCNP07585 359 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TGFB3P10600 412 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC16A2P36021 539 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLCB3Q01970 1234 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSDL1Q3SXM5 330 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RMDN3Q96TC7 470 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TCF25Q9BQ70 676 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP26Q9BXU7 913 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SETD4Q9NVD3 440 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDH22Q9UJ99 828 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FANCMQ8IYD8 2048 aa10.06□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KRBA1A5PL33 1030 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LAMTOR5O43504 91 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CFHP08603 1231 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SCG2P13521 617 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KRT17Q04695 432 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLFN5Q08AF3 891 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARHGEF16Q5VV41 709 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMC7Q7Z402 723 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MCF2L2Q86YR7 1114 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TAAR1Q96RJ0 339 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EPC1Q9H2F5 836 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MLXIPQ9HAP2 919 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MTMR7Q9Y216 660 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SQORQ9Y6N5 450 aa10.05□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HIDE1A8MVS5 230 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GGPS1O95749 300 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LGALS2P05162 132 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NR3C2P08235 984 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WEE2P0C1S8 567 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LAG3P18627 525 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GNAT2P19087 354 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TDO2P48775 406 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADAM17P78536 824 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARHGAP4P98171 946 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 APOBRQ0VD83 1088 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTBK2Q6IQ55 1244 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC149Q6ZUS6 474 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NXPE3Q969Y0 559 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZSCAN32Q9NX65 697 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CA14Q9ULX7 337 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NRCAMQ92823 1304 aa10.04□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NOP56O00567 594 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LRP3O75074 770 aa10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MGAT3Q09327 533 aa10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZBTB44Q8NCP5 570 aa10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LINC01599Q8WXQ3 324 aa10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SHDQ96IW2 340 aa10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BCO2Q9BYV7 579 aa10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAB23Q9ULC3 237 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms