RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC5A5Q92911 643 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MBOAT7Q96N66 472 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RIT2Q99578 217 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 BTBD18B2RXH4 712 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP1P03956 469 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PFKMP08237 780 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 THPOP40225 353 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT76Q01546 638 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GPNMBQ14956 572 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCB4Q15147 1175 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 RASIP1Q5U651 963 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 NEK8Q86SG6 692 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GJA10Q969M2 543 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.412e-7■■□□□ 12.9
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMA3Q16787 3333 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 INSRRP14616 1297 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC26A2P50443 739 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIK4Q16099 956 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR153Q6NV75 609 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF25Q93038 417 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF302Q9NR11 478 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEB3A0JP26 581 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GAS7O60861 476 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PSAPP07602 524 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 IGBP1P78318 339 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEBQ6S5H4 581 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPC6Q9Y210 931 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMM50Q9Y512 469 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMD10O75832 226 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 RSPH10BP0C881 870 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GUCY1B3Q02153 619 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf76Q96K31 380 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM205CA6NFA0 338 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR64B1ANS9 1081 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC37A4O43826 429 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 NBNO60934 754 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTN1P12814 892 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MCM2P49736 904 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 TMX3Q96JJ7 454 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 DISC1Q9NRI5 854 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 HBP1O60381 514 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP4AP20648 1035 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBBXA8MT70 800 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CHMP2AO43633 222 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CAND2O75155 1236 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC34A2O95436 690 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL10P02778 98 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SFNP31947 248 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MBTPS1Q14703 1052 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM20AQ96MK3 541 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-204ENST00000416021 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-204ENST00000416021 JAK3P52333 1124 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-204ENST00000416021 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-204ENST00000416021 RPAINQ86UA6 219 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.82■■□□□ 1.4
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