RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411670.5

CCDC18-AS1-201, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 675 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CD52P31358 61 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 POF1BQ8WVV4 589 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 P2RX5Q93086 422 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PLVAPQ9BX97 442 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HCSTQ9UBK5 93 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.23□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PER2O15055 1255 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FIBPO43427 364 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ATP9AO75110 1047 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GNAT1P11488 350 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MARK3P27448 753 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PPFIA1Q13136 1202 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NEDD9Q14511 834 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GRIK4Q16099 956 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SUSD6Q92537 303 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RILPL2Q969X0 211 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMX1Q9H3N1 280 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CDH22Q9UJ99 828 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NRCAMQ92823 1304 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 H0Y858 1186 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ARP10275 920 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KCNA2P16389 499 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AVPR2P30518 371 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GRM4Q14833 912 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GNPTABQ3T906 1256 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TICAM2Q86XR7 235 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PCYT2Q99447 389 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LNPKQ9C0E8 428 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TLR9Q9NR96 1032 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MGEA5O60502 916 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PPFIA3O75145 1194 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NT5C2P49902 561 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ERVFC1P60507 584 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IGBP1P78318 339 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KCNC3Q14003 757 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PKN1Q16512 942 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PTPN21Q16825 1174 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DUSP6Q16828 381 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PRRX2Q99811 253 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 APOL5Q9BWW9 433 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 S1PR5Q9H228 398 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.2□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MEIS2O14770 477 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FSCN2O14926 492 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 STAM2O75886 525 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ITGB5P18084 799 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 APOBRQ0VD83 1088 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TROAPQ12815 778 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KRT23Q9C075 422 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TLE6Q9H808 572 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms