RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRCAMQ92823 1304 aa24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSMD10O75832 226 aa24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 RETREG2Q8NC44 543 aa24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 GNAT1P11488 350 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 CKBP12277 381 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPFIA1Q13136 1202 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPNMBQ14956 572 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLCB4Q15147 1175 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF365Q70YC5 407 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.92■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 GAS7O60861 476 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SELPP16109 830 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRIK4Q16099 956 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF302Q9NR11 478 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 BACH1O14867 736 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 INSRRP14616 1297 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP4AP20648 1035 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC26A2P50443 739 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 RASIP1Q5U651 963 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 LAMA3Q16787 3333 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 WDR64B1ANS9 1081 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 WNT7AO00755 349 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 RFC2P35250 354 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRCH3Q96II8 777 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 DISC1Q9NRI5 854 aa24.89■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCN5AQ14524 2016 aa24.89■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 POTEB3A0JP26 581 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSAPP07602 524 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 POTEBQ6S5H4 581 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 HERVK_113Q902F9 699 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 HAS1Q92839 578 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRPC6Q9Y210 931 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 KAT6AQ92794 2004 aa24.88■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBX3O15119 743 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHMP2AO43633 222 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 FGBP02675 491 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 PFKMP08237 780 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 SFNP31947 248 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 POTEDQ86YR6 584 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM20AQ96MK3 541 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.87■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 TET1Q8NFU7 2136 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 HBP1O60381 514 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAND2O75155 1236 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 THPOP40225 353 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 JAK3P52333 1124 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 MBTPS1Q14703 1052 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 RDM1Q8NG50 284 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 VAV3Q9UKW4 847 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 SAMM50Q9Y512 469 aa24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 NBNO60934 754 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGBP1P78318 339 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPAINQ86UA6 219 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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