RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 CAVIN2O95810 425 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 AFMP43652 599 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF165P49910 485 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 NLRP12P59046 1061 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 METTL7BQ6UX53 244 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 GH1P01241 217 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 STAT6P42226 847 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGAP1Q07960 439 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 PPP2R5CQ13362 524 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 ISM2Q6H9L7 571 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 RAB34Q9BZG1 259 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 POTEMA6NI47 508 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 CHMP2AO43633 222 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 SP4Q02446 784 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 TLK2Q86UE8 772 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 LUZP1Q86V48 1076 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 PLIN2Q99541 437 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 WDR81Q562E7 1941 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 POTEFA5A3E0 1075 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 CCNE2O96020 404 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 KRT76Q01546 638 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 LAMC2Q13753 1193 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 PDIA5Q14554 519 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 SMARCE1Q969G3 411 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 SPATA33Q96N06 139 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-204ENST00000373436 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 RARBP10826 455 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MTFR1Q15390 333 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 STAMQ92783 540 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 Q9Y3F1 56 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 EML1O00423 815 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 ACTR2P61160 394 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF333Q96JL9 665 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SMC2O95347 1197 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 PLCG1P19174 1290 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 CASP1P29466 404 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 PPTC7Q8NI37 304 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 ARMC5Q96C12 935 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 CALML4Q96GE6 196 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SAMM50Q9Y512 469 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 WDR64B1ANS9 1081 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MSCO60682 206 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 DPYDQ12882 1025 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 AFG1LQ8WV93 481 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 GPR20Q99678 358 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 CCL5P13501 91 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SFNP31947 248 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 JAK3P52333 1124 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 IQCB1Q15051 598 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SPATA20Q8TB22 786 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 LRRC15Q8TF66 581 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MTRQ99707 1265 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 RNF208Q9H0X6 261 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 ATG7O95352 703 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 PGK1P00558 417 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-204ENST00000373436 GJA9P57773 515 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms