RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYTH3O43739 400 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPA4P34932 840 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SP4Q02446 784 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 ENPP3O14638 875 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 MBTPS2O43462 519 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 LINC00271P0C7V0 271 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 XRRA1Q6P2D8 792 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 NLRX1Q86UT6 975 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SGMS1Q86VZ5 419 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLVAPQ9BX97 442 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGFLR1Q9H665 355 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 RXRAP19793 462 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMARCA1P28370 1054 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 LPIN1Q14693 890 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 MICU3Q86XE3 530 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNB2Q92953 911 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 CUL5Q93034 780 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 MMP1P03956 469 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 FGD1P98174 961 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 MGAT3Q09327 533 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPFIA1Q13136 1202 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF135Q8IUD6 432 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD207Q9UJ71 328 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 STXBP3O00186 592 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 APOA5Q6Q788 366 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBX10O75333 385 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 DGKIO75912 1065 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSPG5O95196 566 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.113e-41■■■■■ 39
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAM15Q13444 863 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 FANCBQ8NB91 859 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 P2RX5Q93086 422 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDHR1Q96JP9 859 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-204ENST00000373166 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 C5orf42Q9H799 3197 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIK3CDO00329 1044 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 LINC01565O15544 149 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB43O43298 467 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 NDUFV1P49821 464 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRIK4Q16099 956 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 EDAQ92838 391 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 GLG1Q92896 1179 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MARK3P27448 753 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSMA5P28066 241 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPRASP2Q96D09 838 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIOO75962 3097 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MEIS2O14770 477 aa21.93■■□□□ 1.1
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