RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CUTAO60888 179 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 MAKP20794 623 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 TBR1Q16650 682 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 CFHR4Q92496 578 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 TLR9Q9NR96 1032 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 NR2E1Q9Y466 385 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 ACOT7O00154 380 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 ESYT3A0FGR9 886 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 B2RBV5 119 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 SUSD5O60279 629 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 COL6A2P12110 1019 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 NFYCQ13952 458 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 GPR27Q9NS67 375 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 GRIA2P42262 883 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 IL12RB1P42701 662 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 ETV4P43268 484 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 EPHA5P54756 1037 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP6O43182 974 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 RAMP2O60895 175 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 RECKO95980 971 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 SEC16BQ96JE7 1060 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 SCYL1Q96KG9 808 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 PRRX2Q99811 253 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 LMO1P25800 156 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 MAP4K2Q12851 820 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 GRK2P25098 689 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 GJA4P35212 333 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 GRK3P35626 688 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD1Q719H9 257 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 GPR135Q8IZ08 494 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 TTPALQ9BTX7 342 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 DSEQ9UL01 958 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 FOXN1O15353 648 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 GNAT1P11488 350 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ15Q99712 375 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 MSL2Q9HCI7 577 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 PDE6AP16499 860 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 DLX3O60479 287 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 BMP5P22003 454 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2R2AP63151 447 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 LBX2Q6XYB7 198 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 USP30Q70CQ3 517 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 USP53Q70EK8 1073 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 HMGCRP04035 888 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 ADRA1BP35368 520 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 KCNQ1P51787 676 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 IL13RA1P78552 427 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 GRM7Q14831 915 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.94□□□□□ -1.3
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