RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PROM2Q8N271 834 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L5A8MUK1 530 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 EVI5O60447 810 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CD58P19256 250 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CCT5P48643 541 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PEX3P56589 373 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 LLGL1Q15334 1064 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB33Q86T24 672 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 DNAAF3Q8N9W5 541 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 FAM20AQ96MK3 541 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 UTYO14607 1347 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 WHAMMQ8TF30 809 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MSH2P43246 934 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 Q3C1V9 767 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf54Q08AI8 447 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ARMCX2Q7L311 632 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PRPSAP2O60256 369 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 LIG3P49916 1009 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 OSTNP61366 133 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SHROOM2Q13796 1616 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CACNB3P54284 484 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 BASP1P80723 227 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SATB1Q01826 763 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 NEK9Q8TD19 979 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC11Q96DB2 347 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PREX2Q70Z35 1606 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO40Q9UH90 709 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ESYT2A0FGR8 921 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CLTAP09496 248 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RAPH1Q70E73 1250 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS16A8MUM7 142 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 C21orf2O43822 256 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SYNE4Q8N205 404 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 COL15A1P39059 1388 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC188H7C350 402 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 DYNLT1P63172 113 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD6Q8NC69 237 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 LY9Q9HBG7 655 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SCINQ9Y6U3 715 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA3Q9UL41 463 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 POTEMA6NI47 508 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 KIF3CO14782 793 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 BAG2O95816 211 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SLC8A1P32418 973 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RWDD2BP57060 319 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 KSR1Q8IVT5 923 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CEP120Q8N960 986 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RMDN3Q96TC7 470 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 FMO2Q99518 471 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP4Q96MN2 994 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 BAG5Q9UL15 447 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 KRT3P12035 628 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TCP11Q8WWU5 503 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR1Q13613 665 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 WDR64B1ANS9 1081 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SNAP25P60880 206 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MMEL1Q495T6 779 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 JADE1Q6IE81 842 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms