RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364520.1

RNU6-1141P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1141, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1141P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1141P-201ENST00000364520 TMEM132EQ6IEE7 984 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 LIPIQ6XZB0 460 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 IGDCC3Q8IVU1 814 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 MZB1Q8WU39 189 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 STAG1Q8WVM7 1258 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 DDX11Q96FC9 970 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 NOX5Q96PH1 765 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 YIPF4Q9BSR8 244 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ZMAT4Q9H898 229 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 VTA1Q9NP79 307 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SLC39A2Q9NP94 309 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 TOMM22Q9NS69 142 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 MCM8Q9UJA3 840 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 NUB1Q9Y5A7 615 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PHLDB1Q86UU1 1377 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 FOXP2O15409 715 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ZEB2O60315 1214 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 BRINP1O60477 761 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 KATNA1O75449 491 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PRKD3O94806 890 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 NCAM1P13591 858 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SDHAP31040 664 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 GJA4P35212 333 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 LIMS1P48059 325 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 GUCY2FP51841 1108 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 DLG4P78352 724 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ZNF174Q15697 407 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 OLFML2BQ68BL8 750 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 EFHBQ8N7U6 833 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ASB15Q8WXK1 588 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 BTBD7Q9P203 1132 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 N4BP3O15049 544 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 MPIG6BO95866 241 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 KRT1P04264 644 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CYP2C8P10632 490 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CPEP16870 476 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 AOAHP28039 575 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 NKX3-2P78367 333 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 FOXO4P98177 505 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PFKPQ01813 784 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ADAM9Q13443 819 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SSPNQ14714 243 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 RTP5Q14D33 572 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 TERF2Q15554 542 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 DDB1Q16531 1140 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 BROXQ5VW32 411 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 LRSAM1Q6UWE0 723 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CILP2Q8IUL8 1156 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CMIPQ8IY22 773 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 TMEFF1Q8IYR6 380 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SLC5A5Q92911 643 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 KCNN1Q92952 543 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 C16orf92Q96LL3 132 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 GBP4Q96PP9 640 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 GORASP1Q9BQQ3 440 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 AMNQ9BXJ7 453 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 RNF38Q9H0F5 515 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 ACSS2Q9NR19 701 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1141P-201ENST00000364520 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms