RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 BICD2Q8TD16 824 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 GLG1Q92896 1179 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SDF4Q9BRK5 362 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SETD4Q9NVD3 440 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 NFASCO94856 1347 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 NRCAMQ92823 1304 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 EVPLQ92817 2033 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 FAM86B1E9PN63 330 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 MEIS1O00470 390 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 CAND2O75155 1236 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 CTSHP09668 335 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 RSPH10BP0C881 870 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 ARP10275 920 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 MYOGP15173 224 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 MARK3P27448 753 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 PPFIA1Q13136 1202 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 STK3Q13188 491 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.72□□□□□ -1.01
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SGMS1-201ENST00000361543 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 AZI2Q9H6S1 392 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.72□□□□□ -1.01
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SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB14O75071 495 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 LGR5O75473 907 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 DEXIO95424 95 aa8.71□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 CYP3A4P08684 503 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ACTR2P61160 394 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM17P78536 824 aa8.71□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 PCYT2Q99447 389 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TRPC6Q9Y210 931 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf42Q9H799 3197 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 COL4A6Q14031 1691 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 CDKL5O76039 1030 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 CCNE2O96020 404 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP5P59047 1200 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 IGBP1P78318 339 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB103AP81534 67 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 IKBKEQ14164 716 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD1Q15327 319 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 UIMC1Q96RL1 719 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ARID2Q68CP9 1835 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 KIF28PB7ZC32 967 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 BACH1O14867 736 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TLL1O43897 1013 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 PFKFB2O60825 505 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ATG7O95352 703 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 INSRRP14616 1297 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 CIITAP33076 1130 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A2P50443 739 aa8.69□□□□□ -1.02
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