RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361354.8

NCKAP1-202, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 20,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-202ENST00000361354 DLGAP3O95886 979 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 SOX6P35712 828 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 MESDQ14696 234 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ARL13BQ3SXY8 428 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TTC8Q8TAM2 541 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KLC1Q07866 573 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ZBED1O96006 694 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 SERPINB3P29508 390 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 LCMT1Q9UIC8 334 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 B4E1Z4 1266 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TK2O00142 265 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 NDUFAF2Q8N183 169 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 FAM167BQ9BTA0 163 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CEP95Q96GE4 821 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TSPY1Q01534 308 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ULK4Q96C45 1275 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TMEM161AQ9NX61 479 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 BBS2Q9BXC9 721 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 HAUS5O94927 633 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 MBD4O95243 580 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CDC27P30260 824 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 PDCD10Q9BUL8 212 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 GMEB1Q9Y692 573 aa9□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 EPHB1P54762 984 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TTC17Q96AE7 1141 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 PANK4Q9NVE7 773 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KRT77Q7Z794 578 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 MSH6P52701 1360 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KCNA3P22001 575 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ECT2Q9H8V3 914 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 GUCA1CO95843 209 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KRT16P08779 473 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KRT17Q04695 432 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CHMLP26374 656 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CAPZA2P47755 286 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 SLC35F6Q8N357 371 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 GCNT4Q9P109 453 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 NT5C1BQ96P26 610 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 MRGBPQ9NV56 204 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 SENP1Q9P0U3 644 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 PLAAQ9Y263 795 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ZBED4O75132 1171 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ADALQ6DHV7 355 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ARL4CP56559 192 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 MEIS3Q99687 375 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KLHL18O94889 574 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 RALBP11234 206 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CAV1Q03135 178 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CYGBQ8WWM9 190 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 ATP8B2P98198 1209 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KRT73Q86Y46 540 aa8.99□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 IGHDP01880 384 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 DYNLT1P63172 113 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 CASP8Q14790 479 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 POTEAQ6S8J7 498 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 HIC1Q14526 733 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 UBE4BO95155 1302 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 AP4S1Q9Y587 144 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 RASA4BC9J798 803 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 SLC27A2O14975 620 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 RASA4O43374 803 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 PFKFB1P16118 471 aa8.98□□□□□ -0.97
NCKAP1-202ENST00000361354 HADHAP40939 763 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms