RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359175.8

SPTSSB-201, Transcript of serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTSSB, Length 3,103 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSB-201ENST00000359175 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 C5P01031 1676 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RICTORQ6R327 1708 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 KLRC1P26715 233 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DBN1Q16643 649 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PDXDC1Q6P996 788 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FITM2Q8N6M3 262 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FANCBQ8NB91 859 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PICK1Q9NRD5 415 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PNMA3Q9UL41 463 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SMAPO00193 183 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 AGTP01019 485 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ADD2P35612 726 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 VWA3BQ502W6 1294 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CHD4Q14839 1912 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 KCNK3O14649 394 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ATP6V1G1O75348 118 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SCARF1Q14162 830 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RPS6KA1Q15418 735 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ALX1Q15699 326 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 OPTNQ96CV9 577 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PKN1Q16512 942 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CROCCP2Q86T23 111 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TMTC2Q8N394 836 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DISC1Q9NRI5 854 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SCOCQ9UIL1 159 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 UNC5CO95185 931 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 INHBCP55103 352 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 WTAPQ15007 396 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CNGA2Q16280 664 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 IP6K1Q92551 441 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKS1AQ92625 1134 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 MKL1Q969V6 931 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 NDNQ99608 321 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 MTA3Q9BTC8 594 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 LTN1O94822 1766 aa14.47□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RXRBP28702 533 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PPP1R2P41236 205 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 USP11P51784 963 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 AZIN2Q96A70 460 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FMO2Q99518 471 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TRAPPC10P48553 1259 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PPP2R5BQ15173 497 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 LCA5Q86VQ0 697 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PREBQ9HCU5 417 aa14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.46□□□□□ -0.1
SPTSSB-201ENST00000359175 ADORA1P30542 326 aa14.46□□□□□ -0.1
SPTSSB-201ENST00000359175 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
SPTSSB-201ENST00000359175 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms