RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 KIF3CO14782 793 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 FANCCQ00597 558 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SP4Q02446 784 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 PSMD2Q13200 908 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 MCM3APO60318 1980 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SLC10A3P09131 477 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 PPP1R2P41236 205 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 EHHADHQ08426 723 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 GIT2Q14161 759 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 DRC7Q8IY82 874 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SPC24Q8NBT2 197 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 RDM1Q8NG50 284 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 REEP2Q9BRK0 252 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 IFNKQ9P0W0 207 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SERPINC1P01008 464 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 SP2Q02086 613 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF18P17022 549 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 UGCGQ16739 394 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ADORA2AP29274 412 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 PSMC5P62195 406 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CPA4Q9UI42 421 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ACTR2P61160 394 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 LYPLA2O95372 231 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 PSAPP07602 524 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CDC25BP30305 580 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 LRRC41Q15345 812 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 GPR142Q7Z601 462 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 P2RX5Q93086 422 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 STRNO43815 780 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 RSPH10BP0C881 870 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CCNE1P24864 410 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 C4orf19Q8IY42 314 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM47Q96LD4 638 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 POLD4Q9HCU8 107 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 BICDL2A1A5D9 508 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ASB14A6NK59 587 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 UBASH3AP57075 661 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 MYH11P35749 1972 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CBFA2T2O43439 604 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 SFR1Q86XK3 245 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 IFNL1Q8IU54 200 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC102AQ96A19 550 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 KCND2Q9NZV8 630 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.78■■□□□ 1.24
TRIM4-202ENST00000354241 FAM13AO94988 1023 aa22.78■■□□□ 1.24
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