RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SFNP31947 248 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ARMCX2Q7L311 632 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC68Q9H2F9 335 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 POTEMA6NI47 508 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf60Q5U649 245 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1841Q6NSI8 718 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 RFX6Q8HWS3 928 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PROM2Q8N271 834 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCY2DQ02846 1103 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf31Q8N865 590 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPRMP28827 1452 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8KD6RF30 607 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MARK3P27448 753 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 OSTNP61366 133 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PRPSAP1Q14558 356 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 STRIP1Q5VSL9 837 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR5LQ6MZQ0 368 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 BARGINQ6ZT62 677 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CATSPER4Q7RTX7 472 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGOQ8TEQ8 1089 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PANX2Q96RD6 677 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP8B3O60423 1300 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 COPB2P35606 906 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC13Q8IYE1 715 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM114A2Q9NRY5 505 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 JRKLQ9Y4A0 524 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GNAT1P11488 350 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 INPP5BP32019 993 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CSF1RP07333 972 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC27P30260 824 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT31Q15323 416 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL4AP40617 200 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PADI6Q6TGC4 694 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 AGLP35573 1532 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK6Q16659 721 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 TTBK2Q6IQ55 1244 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 UBN2Q6ZU65 1347 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GDAQ9Y2T3 454 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CUL4BQ13620 913 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ENC1O14682 589 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFA10O95299 355 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRF4Q8IZF3 695 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MB21D1Q8N884 522 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MGARPQ8TDB4 240 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 ACAD9Q9H845 621 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MED4Q9NPJ6 270 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 P4HBP07237 508 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 AKR1B1P15121 316 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MUM1L1Q5H9M0 696 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 XXYLT1Q8NBI6 393 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 OXER1Q8TDS5 423 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD54LQ92698 747 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 RILPQ96NA2 401 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR70Q9NW82 654 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SEL1LQ9UBV2 794 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCA1LA6NCM1 817 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CD58P19256 250 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA3FQ13275 785 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 PBKQ96KB5 322 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8IPA6NC78 632 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC160A6NGH7 325 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8JA6NMD2 632 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GARSP41250 739 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 USP11P51784 963 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8FQ08AF8 430 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SGO2Q562F6 1265 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 SGK1O00141 431 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 HGSO14964 777 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MCF2LO15068 1137 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms