RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 KRT79Q5XKE5 535 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 DDX12PQ92771 950 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 A0A1B0GUA9 196 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 LRRC63Q05C16 580 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 VAV2P52735 878 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 MAN2A1Q16706 1144 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 TTMPQ5BVD1 217 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 MRIQ9BWK5 157 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 IDI2Q9BXS1 227 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 JADE2Q9NQC1 790 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SLC1A4P43007 532 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 IFT88Q13099 833 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 NAA35Q5VZE5 725 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 KCTD16Q68DU8 428 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 DCAF4Q8WV16 495 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CCDC42Q96M95 316 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PSMD2Q13200 908 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SNCBQ16143 134 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 MKL1Q969V6 931 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 NYAP2Q9P242 653 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ANO9A1A5B4 782 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SLFN13Q68D06 897 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CAGE1Q8TC20 777 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PSMB7Q99436 277 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CDR1P51861 262 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PPARDQ03181 441 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 STYK1Q6J9G0 422 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ETAA1Q9NY74 926 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L15C9J2P7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L11C9JVI0 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L18D6R9N7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L22D6RA61 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L19D6RCP7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L20D6RJB6 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 H0YIN7 160 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ADCY2Q08462 1091 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L24Q0WX57 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SEPT2Q15019 361 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SEC24CP53992 1094 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 GUCY1A3Q02108 690 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 KIF5AQ12840 1032 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 MARCH6O60337 910 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 LCA5LO95447 670 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ICA1Q05084 483 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 C2orf54Q08AI8 447 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 COASYQ13057 564 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ACCSLQ4AC99 568 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 BAP1Q92560 729 aa22.08■■□□□ 1.13
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