RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 NRCAMQ92823 1304 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 TREHO43280 583 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 GAS7O60861 476 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PPFIA1Q13136 1202 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 LRCH2Q5VUJ6 765 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 WNT8BQ93098 351 aa28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SLC37A4O43826 429 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 IQCF3P0C7M6 154 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SLC26A2P50443 739 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 RBL2Q08999 1139 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM240Q5SV17 173 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 FAM160B1Q5W0V3 765 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SAMM50Q9Y512 469 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa28.24■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 LAMA3Q16787 3333 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 CKBP12277 381 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 ADAM17P78536 824 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 GRIK4Q16099 956 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SWSAP1Q6NVH7 229 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF365Q70YC5 407 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 ETNPPLQ8TBG4 499 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF302Q9NR11 478 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 TRPC6Q9Y210 931 aa28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 CHMP2AO43633 222 aa28.22■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PSMD10O75832 226 aa28.22■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PSAPP07602 524 aa28.22■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SELPP16109 830 aa28.22■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PLCB4Q15147 1175 aa28.22■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.22■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 WDR81Q562E7 1941 aa28.22■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 WDR64B1ANS9 1081 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 RFC2P35250 354 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 THPOP40225 353 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 IGBP1P78318 339 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 UNC45AQ9H3U1 944 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 DISC1Q9NRI5 854 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 KIF3AQ9Y496 699 aa28.21■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 POTEB3A0JP26 581 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 FGBP02675 491 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 INSRRP14616 1297 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 POTEBQ6S5H4 581 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 VWCEQ96DN2 955 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 LRCH3Q96II8 777 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 FAM20AQ96MK3 541 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 KCNMB3Q9NPA1 279 aa28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.19■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 PFKMP08237 780 aa28.19■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 SFNP31947 248 aa28.19■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.19■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.19■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 TUBE1Q9UJT0 475 aa28.19■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 TBX3O15119 743 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 JAK3P52333 1124 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 B3GNT9Q6UX72 402 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 POTEDQ86YR6 584 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 ATP8B4Q8TF62 1192 aa28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 MARCH6O60337 910 aa28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 ATP4AP20648 1035 aa28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 RDM1Q8NG50 284 aa28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.17■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 TET1Q8NFU7 2136 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 HBP1O60381 514 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 CAND2O75155 1236 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 HERVK_113Q902F9 699 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 HAS1Q92839 578 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.16■■■□□ 2.1
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