RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 AZI2Q9H6S1 392 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP45Q9UL16 551 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 GRIN2DO15399 1336 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PSEN2P49810 448 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 MFSD10Q14728 455 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SNX17Q15036 470 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 NEK9Q8TD19 979 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 GLG1Q92896 1179 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF302Q9NR11 478 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ARID2Q68CP9 1835 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 BACH1O14867 736 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PPP6R2O75170 966 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PSMC6P62333 389 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 KRT85P78386 507 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ITGA7Q13683 1181 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 STK38Q15208 465 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SESTD1Q86VW0 696 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PSMC5P62195 406 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 UGCGQ16739 394 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 AK8Q96MA6 479 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 STK24Q9Y6E0 443 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ARVCFO00192 962 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SPTLC2O15270 562 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF862O60290 1169 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ATP4AP20648 1035 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 HOXC8P31273 242 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 CDK7P50613 346 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PLCB4Q15147 1175 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 BANK1Q8NDB2 785 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ERMNQ8TAM6 284 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 FAM167AQ96KS9 214 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 LXNQ9BS40 222 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 EVPLQ92817 2033 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SLITRK3O94933 977 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 STBD1O95210 358 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 LYPLA2O95372 231 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 MUTP22033 750 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 MARK3P27448 753 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 RPA1P27694 616 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PRKCEQ02156 737 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 GRIN1Q05586 938 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 C4orf19Q8IY42 314 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 DYDC2Q96IM9 177 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 RGL1Q9NZL6 768 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 NRCAMQ92823 1304 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 POTEB3A0JP26 581 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms