RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CALN1Q9BXU9 219 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SCINQ9Y6U3 715 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PDIK1LQ8N165 341 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CCNYQ8ND76 341 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV5-2P06315 115 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SNX25Q9H3E2 840 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 MID2Q9UJV3 735 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 AKT3Q9Y243 479 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF233A6NK53 670 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DDIT3P35638 169 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 GRAPQ13588 217 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD6Q8NC69 237 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO41Q8TF61 875 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FGGP02679 453 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PSAPP07602 524 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CENPUQ71F23 418 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TBK1Q9UHD2 729 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TLK1Q9UKI8 766 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SETSIPP0DME0 302 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DYNLT1P63172 113 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA3FQ13275 785 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PRPSAP2O60256 369 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TERF2Q15554 542 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SUSD4Q5VX71 490 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 E2F5Q15329 346 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PIGBQ92521 554 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CA4P22748 312 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 LLGL1Q15334 1064 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.77■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.77■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 APOL6Q9BWW8 343 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 STMN1P16949 149 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 BBS9Q3SYG4 887 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 MTERF2Q49AM1 385 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 COA1Q9GZY4 146 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1EQ12965 1108 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ALX1Q15699 326 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM4Q9C037 500 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PCGF5Q86SE9 256 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 MCUQ8NE86 351 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TTI1O43156 1089 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PALMO75781 387 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH3Q86UC2 560 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF4Q8WV16 495 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PLAAQ9Y263 795 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SKIP12755 728 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 GUCY2CP25092 1073 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms