RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 COG2Q14746 738 aa20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 TSC1Q92574 1164 aa20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 RIPK3Q9Y572 518 aa20.91■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 A0A1W2PQJ5 194 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 ZBTB39O15060 712 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 ZBED6P86452 979 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 PGM5Q15124 567 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 CHP1Q99653 195 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 RNF146Q9NTX7 359 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 RMDN3Q96TC7 470 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 PXMP2Q9NR77 195 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.9■□□□□ 0.94
GDPD1-201ENST00000284116 HOXD13P35453 343 aa20.89■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.89■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 WDR59Q6PJI9 974 aa20.89■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 NSMFQ6X4W1 530 aa20.89■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.89■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 KCND2Q9NZV8 630 aa20.89■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MYBP10242 640 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ADAM9Q13443 819 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MTMR1Q13613 665 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MEA1Q16626 185 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 LXNQ9BS40 222 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PDXKO00764 312 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ATP2A1O14983 1001 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 CETN3O15182 167 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 FAM13AO94988 1023 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 GNG11P61952 73 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 BANK1Q8NDB2 785 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 POLD4Q9HCU8 107 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 FANCGO15287 622 aa20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PRKG1Q13976 671 aa20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 WDR90Q96KV7 1748 aa20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 SFI1A8K8P3 1242 aa20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MYCT1Q8N699 235 aa20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.86■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MYH11P35749 1972 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 NDUFA10O95299 355 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 GCNT3O95395 438 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 CASQ1P31415 396 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF131P52739 623 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MAP3K9P80192 1104 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 WDR24Q96S15 920 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PARVGQ9HBI0 331 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
GDPD1-201ENST00000284116 RNF181Q9P0P0 153 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms