RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 ABCB4P21439 1286 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TECP42680 631 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PMS2P54278 862 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SLC29A2Q14542 456 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 MFN1Q8IWA4 741 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 METTL13Q8N6R0 699 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RGL1Q9NZL6 768 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SLC12A4Q9UP95 1085 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 NFS1Q9Y697 457 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SLIT1O75093 1534 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RARAP10276 462 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TUBP50607 506 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 AMPD3Q01432 767 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 KLC1Q07866 573 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ITIH4Q14624 930 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SEPT2Q15019 361 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 NAB2Q15742 525 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 MEI1Q5TIA1 1274 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ANKS1AQ92625 1134 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 FGD4Q96M96 766 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 GBP5Q96PP8 586 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TBK1Q9UHD2 729 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PXDNQ92626 1479 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 GSG1L2A8MUP6 293 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTS3O15072 1205 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 NMT2O60551 498 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CIAO1O76071 339 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RHOBTB3O94955 611 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SERPING1P05155 500 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 FESP07332 822 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SCG2P13521 617 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 STX2P32856 288 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RIPK1Q13546 671 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM74Q86UV6 250 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM73Q86UV7 250 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM237Q96Q45 408 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PQJ5 194 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CDK17Q00537 523 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SETDB1Q15047 1291 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CALML4Q96GE6 196 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 EPAS1Q99814 870 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PICK1Q9NRD5 415 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 FAM114A2Q9NRY5 505 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 INTUQ9ULD6 942 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RASGRF2O14827 1237 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 BLIDQ8IZY5 108 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PTPN22Q9Y2R2 807 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 FOXO6A8MYZ6 492 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ASAP2O43150 1006 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ACSL3O95573 720 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CNGA1P29973 690 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TXKP42681 527 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RCN2Q14257 317 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TAOK1Q7L7X3 1001 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SEMA6BQ9H3T3 888 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM165Q9HC07 324 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SCOCQ9UIL1 159 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 KLRC4O43908 158 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 EMC10Q5UCC4 262 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA21Q7Z572 469 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PBKQ96KB5 322 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM9Q9C026 710 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ABCC12Q96J65 1359 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 MYH6P13533 1939 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SNX3O60493 162 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TARSP26639 723 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINB4P48594 390 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF131P52739 623 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 DR1Q01658 176 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TXNRD1Q16881 649 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA5Q8NB90 893 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 GREM2Q9H772 168 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 VAT1LQ9HCJ6 419 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 SIK3Q9Y2K2 1263 aa12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms