RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 PAK2Q13177 524 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 PEX26Q7Z412 305 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 PACS2Q86VP3 889 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ZBTB5O15062 677 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 HGSNATQ68CP4 663 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 MYCT1Q8N699 235 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 AMACRQ9UHK6 382 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 E7EVH7 732 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 NOL4O94818 638 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CCDC174Q6PII3 467 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.8□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 KRIT1O00522 736 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 EDIL3O43854 480 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CYP11B2P19099 503 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 PLAAQ9Y263 795 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 REEP2Q9BRK0 252 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 GCNT4Q9P109 453 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 USP21Q9UK80 565 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 TRIM49P0CI25 452 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 TRIM49CP0CI26 452 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.79□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ITGA4P13612 1032 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 TNNC1P63316 161 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 SLC18A3Q16572 532 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 FIGNQ5HY92 759 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ERLIN2O94905 339 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 KRT13P13646 458 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CERS5Q8N5B7 392 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 SNED1Q8TER0 1413 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 FAM13AO94988 1023 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 INPP5BP32019 993 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 ARHGAP4P98171 946 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 UCHL3P15374 230 aa14.77□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 MNAT1P51948 309 aa14.77□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 PDIA5Q14554 519 aa14.77□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.77□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.77□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 BCORQ6W2J9 1755 aa14.77□□□□□ -0.04
VHL-201ENST00000256474 DAPK3O43293 454 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TMOD1P28289 359 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 MAGEA9P43362 315 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 LRP5O75197 1615 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 AKAP3O75969 853 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NR1D1P20393 614 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ICA1Q05084 483 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 COG2Q14746 738 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EMBQ6PCB8 327 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PPM1EQ8WY54 764 aa14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 IFT88Q13099 833 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 DOCK2Q92608 1830 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SHMT1P34896 483 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NAB2Q15742 525 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 VPS36Q86VN1 386 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ERMNQ8TAM6 284 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TEKT1Q969V4 418 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CASZ1Q86V15 1759 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms