RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PARD6BQ9BYG5 372 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PSD3Q9NYI0 1048 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8FQ08AF8 430 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FILIP1LQ4L180 1135 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RPTORQ8N122 1335 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ERICH4A6NGS2 130 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF5CO60282 957 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2SQ16763 222 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 BARHL2Q9NY43 387 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ITIH6Q6UXX5 1313 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CNGA1P29973 690 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NAPAP54920 295 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GHRHRQ02643 423 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB118Q96PH6 123 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GSDMAQ96QA5 445 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 KATNBL1Q9H079 304 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR29P0C7W0 189 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2MP0CAP2 368 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FECHP22830 423 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM63BQ5T3F8 832 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CNGA4Q8IV77 575 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 RMDN3Q96TC7 470 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PSTPIP2Q9H939 334 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS54Q9P1Q0 977 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 OAS2P29728 719 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FERMT2Q96AC1 680 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX58Q96C10 678 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT8Q9BYC5 575 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRG1Q9Y653 693 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TULP2O00295 520 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PBX1P40424 430 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PDGFCQ9NRA1 345 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO1AQ9UBC5 1043 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC23Q9UJX2 597 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP4BP1P59074 171 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF1Q13077 416 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKAL1Q5VV42 579 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 IL31RAQ8NI17 732 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC4Q96A65 974 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY6O43306 1168 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ERLIN1O75477 346 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SASH3O75995 380 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC20A2Q08357 652 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SMCO2A6NFE2 343 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2K7O14733 419 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SPECC1Q5M775 1068 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF22Q8N9C0 903 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PXMP2Q9NR77 195 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB21Q9UL25 225 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ACVR2BQ13705 512 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX8Q68G74 356 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MSANTD4Q8NCY6 345 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 DNERQ8NFT8 737 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MED15Q96RN5 788 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CSRNP2Q9H175 543 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB14A6NK59 587 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 EDNRBP24530 442 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CUL4BQ13620 913 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LONRF2Q1L5Z9 754 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF16Q5VV41 709 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MORC4Q8TE76 937 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM260Q9NX78 707 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ14Q9UNX9 436 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 GJB1P08034 283 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM14Q14142 442 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MFAP3LO75121 409 aa29.2■■■□□ 2.27
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