RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 AOC1P19801 751 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TECP42680 631 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 NPAS4Q8IUM7 802 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 APOL5Q9BWW9 433 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA4AQ9H3S1 761 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa19.17■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 FSCN2O14926 492 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 SRGAP2BP0DMP2 458 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 ERVFC1P60507 584 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO47Q5MNV8 452 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 RASGRP4Q8TDF6 673 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 BCAS3Q9H6U6 928 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.16■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 PI15O43692 258 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 PPFIA3O75145 1194 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 ASGR2P07307 311 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TGFB3P10600 412 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A1P11836 297 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP4P98171 946 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TSHZ3Q63HK5 1081 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM50Q86XT4 487 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 USP26Q9BXU7 913 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 LRRCC1Q9C099 1032 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 POMKQ9H5K3 350 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 MLXIPQ9HAP2 919 aa19.15■□□□□ 0.66
SPCS1-201ENST00000233025 OPLAHO14841 1288 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 NPR3P17342 541 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GATMP50440 423 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 HSD17B4P51659 736 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GHRHRQ02643 423 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 DTWD2Q8NBA8 298 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 FLCNQ8NFG4 579 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 IL31RAQ8NI17 732 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 UBA5Q9GZZ9 404 aa19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 FASNP49327 2511 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa19.13■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TAF2Q6P1X5 1199 aa19.13■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 NRCAMQ92823 1304 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 NOP56O00567 594 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 FGF18O76093 207 aa19.11■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 STAG3L1P0CL83 205 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 CD52P31358 61 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 LLGL2Q6P1M3 1020 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 STOX1Q6ZVD7 989 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 CYP2W1Q8TAV3 490 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GPR20Q99678 358 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa19.11■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.1■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa19.1■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TTC14Q96N46 770 aa19.1■□□□□ 0.65
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SPCS1-201ENST00000233025 TOMM22Q9NS69 142 aa19.1■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 VPS53Q5VIR6 699 aa19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 METTL7BQ6UX53 244 aa19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 HCSTQ9UBK5 93 aa19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SPCS1-201ENST00000233025 HIDE1A8MVS5 230 aa19.08■□□□□ 0.64
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