RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.79■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 SETD4Q9NVD3 440 aa24.79■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.79■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 SIP14410 1827 aa24.78■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 STK3Q13188 491 aa24.78■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 HIC1Q14526 733 aa24.78■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.78■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 AZI2Q9H6S1 392 aa24.78■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.78■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 COG5Q9UP83 839 aa24.78■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 TREHO43280 583 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 NBNO60934 754 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 CXCL10P02778 98 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 DEFB103AP81534 67 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 TCTN1Q2MV58 587 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.77■■□□□ 1.56
NME4-201ENST00000219479 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ARP10275 920 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 MARK3P27448 753 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 WNT8BQ93098 351 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 NFASCO94856 1347 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 EMSYQ7Z589 1322 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 NRCAMQ92823 1304 aa24.76■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 MEIS1O00470 390 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 RSPH10BP0C881 870 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 HOXC8P31273 242 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 NLRP5P59047 1200 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ANAPC15P60006 121 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.75■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.74■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 PPFIA1Q13136 1202 aa24.74■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.74■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 HLA-CQ95604 372 aa24.74■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.74■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.74■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 CAND2O75155 1236 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 CDKL5O76039 1030 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 DEXIO95424 95 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 CYP3A4P08684 503 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 CTSHP09668 335 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ACTR2P61160 394 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.73■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 FAM86B1E9PN63 330 aa24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 GJB5O95377 273 aa24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ANKRD1Q15327 319 aa24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 TRPC6Q9Y210 931 aa24.72■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 EFCAB14O75071 495 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 LGR5O75473 907 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 PLA2G5P39877 138 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 IKBKEQ14164 716 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 MBTPS1Q14703 1052 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 GRIK4Q16099 956 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 RSPH3Q86UC2 560 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.71■■□□□ 1.55
NME4-201ENST00000219479 BACH1O14867 736 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 ADAMTS3O15072 1205 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 IGBP1P78318 339 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 PRR16Q569H4 304 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 RAD9AQ99638 391 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 EPHX3Q9H6B9 360 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.7■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 LINC01553A4QN01 128 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 STAT5BP51692 787 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 ERVK-21P61565 698 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 ADAM17P78536 824 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 UIMC1Q96RL1 719 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-201ENST00000219479 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms