RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027878.13

Prrx1-201, Transcript of Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prrx1, Length 4,952 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ift88Q61371 824 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krt32Q62168 407 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cd180Q62192 661 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cfap100Q80VN0 613 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mospd1Q8VEL0 213 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Calb1P12658 261 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 LtbrP50284 415 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pdrg1P59048 133 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tspyl3Q3UYP3 334 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sept5Q9Z2Q6 369 aa11.9□□□□□ -0.5
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fam205a1D3YZF6 1314 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Il6stQ00560 917 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Nlrp9bQ66X22 1003 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tmco3Q8BH01 678 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Setd1bQ8CFT2 1985 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Kbtbd4Q8R179 534 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Klhl35Q9CZ49 574 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Extl3Q9WVL6 918 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zkscan16A2ALW2 728 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Trmt1lA2RSY6 728 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pnmal2G3X9N3 661 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Oas1aP11928 367 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sept4P28661 478 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tshz2Q68FE9 1030 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Oas1gQ8K469 367 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm13084A2A8N0 494 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Spdye4aQ5IBH6 268 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 SkiQ60698 725 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 DaglaQ6WQJ1 1044 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Q8C5S3 137 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm10378F6XQQ1 160 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 EzrP26040 586 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Bend4P86174 541 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 E2f8Q58FA4 860 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mxd4Q60948 209 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 VwdeQ6DFV8 926 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Kat14Q8CID0 779 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pik3c2aQ61194 1686 aa11.89□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tex13cD3YU32 604 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Znf568E9PYI1 671 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Slc2a4P14142 509 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pfdn6Q03958 127 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Meis1Q60954 390 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Caps2Q8BUG5 550 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Senp7Q8BUH8 1037 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lrrd1Q8C0R9 853 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cuedc2Q9CXX9 284 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Serpinb12Q9D7P9 423 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pik3caP42337 1068 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sgpl1Q8R0X7 568 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zfp566Q8VCI1 386 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Polr3fQ921X6 316 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ppp1r16aQ923M0 524 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 PplQ9R269 1755 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Trpm1Q2TV84 1622 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ssc5dQ8BV57 1371 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ambra1A2AH22 1300 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Foxm1O08696 760 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Atg9aQ68FE2 551 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zfp943Q6NZP4 507 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Slc13a3Q91Y63 600 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cnpy3Q9DAU1 276 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gna14P30677 355 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Myo1fP70248 1099 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Slc10a5Q5PT54 434 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ephb1Q8CBF3 984 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Atg13Q91YI1 516 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 PdgfdQ925I7 370 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pin4Q9CWW6 131 aa11.88□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 NpeppsQ11011 920 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccdc34Q3UI66 367 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Nt5c2Q3V1L4 560 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mum1l1Q4VA55 681 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Klra7Q60654 280 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fam214aQ69ZK7 1075 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Best2Q8BGM5 508 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gbp5Q8CFB4 590 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tm4sf4Q91XD3 202 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Syt17Q920M7 470 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 NfkbizQ9EST8 728 aa11.87□□□□□ -0.51
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.7 ms