RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc55Q3UY51 311 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 E330017A01RikQ8BU47 192 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vmn1r218Q8R261 298 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MlxipQ2VPU4 917 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 HrQ61645 1182 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Grm4Q68EF4 912 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 WhrnQ80VW5 918 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AsphQ8BSY0 741 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cmtr1Q9DBC3 837 aa10.22□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Frmpd4A2AFR3 1320 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adgra3Q7TT36 1310 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GakQ99KY4 1305 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttc38A3KMP2 465 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pagr1bF6V0H0 108 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krt8P11679 490 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fbln2P37889 1221 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lamc2Q61092 1191 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pacsin1Q61644 441 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf280dQ68FE8 974 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hdac10Q6P3E7 666 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nyap1Q6PFX7 833 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Acad11Q80XL6 779 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tor4aQ8BH02 426 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kctd6Q8BNL5 237 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rint1Q8BZ36 792 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spata16Q8C636 571 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Parp10Q8CIE4 960 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q922C1 641 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dhx58Q99J87 678 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pagr1aQ99L02 253 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Psma8Q9CWH6 250 aa10.21□□□□□ -0.77
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pik3caP42337 1068 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Arhgap44Q5SSM3 814 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Scnn1aQ61180 699 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kcnv2Q8CFS6 562 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bbs7Q8K2G4 715 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Acot3Q9QYR7 432 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc15Q80X72 579 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cbwd1Q8VEH6 393 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc91Q9D8L5 442 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tacc3Q9JJ11 631 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klra10Q9R1G6 266 aa10.21□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm45194A0A140LJG2 572 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Clrn2B2RVW2 232 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm1758F6VZZ1 202 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfp42P22227 288 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q3TTJ4 293 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trpc6Q61143 930 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ctnna2Q61301 953 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krt42Q6IFX2 452 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lgi2Q8K4Z0 550 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Alg1Q921Q3 482 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MesdQ9ERE7 224 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm382B1AXN3 1250 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Akr1b10G5E895 316 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Chmp6P0C0A3 200 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdc25aP48964 514 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nol4P60954 483 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Clca4aQ6Q473 924 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mettl13Q91YR5 698 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 IqcdQ9D3V1 458 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm45208A0A140LJ36 292 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Irx1P81068 480 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ArsiQ32KI9 573 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 DaglaQ6WQJ1 1044 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AdalQ80SY6 360 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GgcxQ9QYC7 757 aa10.2□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sema4dO09126 861 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hsd17b1P51656 344 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MagohP61327 146 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 BC051142Q3V0M8 400 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rasa3Q60790 834 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AopepQ8BXQ6 817 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CgasQ8C6L5 507 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MagohbQ9CQL1 146 aa10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fgd3O88842 733 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.6 ms