RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636773.1

CACNB4-233, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-233	ENST00000636773	NDUFB5	O43674	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CIAO1	O76071	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	MME	P08473	750 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	BDNF	P23560	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	KAT2B	Q92831	832 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	VPS18	Q9P253	973 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773		F5H6K3	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	FGB	P02675	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	SCG2	P13521	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CDK8	P49336	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CCL23	P55773	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	KLRC3	Q07444	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	VGLL4	Q14135	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	IKBKE	Q14164	716 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CEP68	Q76N32	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773		H7C1W4	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	LGR5	O75473	907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	INHA	P05111	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	RXRA	P19793	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	KIF11	P52732	1056 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PRR16	Q569H4	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	DDX12P	Q92771	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	EPAS1	Q99814	870 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	7e-6	■□□□□ 9.4
CACNB4-233	ENST00000636773	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	KPNA6	O60684	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	E2F6	O75461	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	CABYR	O75952	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	BACE1	P56817	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	AMPD2	Q01433	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773		Q4G0T1	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	HOXA2	O43364	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	BMP15	O95972	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-233	ENST00000636773	GBP1	P32455	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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