RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	DYM	Q7RTS9	669 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF384	Q8TF68	577 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PDE8A	O60658	829 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	KIF4A	O95239	1232 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PEX19	P40855	299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	BIRC2	Q13490	618 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	METTL13	Q8N6R0	699 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	KIF3C	O14782	793 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	USP11	P51784	963 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	RIPK1	Q13546	671 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	DPH5	Q9H2P9	285 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CEP72	Q9P209	647 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218		A8MUI8	341 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	MME	P08473	750 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TNS2	Q63HR2	1409 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PRPH	P41219	470 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TAF4B	Q92750	862 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CENPT	Q96BT3	561 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SWAP70	Q9UH65	585 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	KRIT1	O00522	736 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CYTH3	O43739	400 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	UPP2	O95045	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PPP1R2	P41236	205 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CEP120	Q8N960	986 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SEC14L1	Q92503	715 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CACNA1S	Q13698	1873 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ABCB11	O95342	1321 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	LRP5	O75197	1615 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ENO4	A6NNW6	628 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CES2	O00748	559 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ASAP2	O43150	1006 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	GSTA1	P08263	222 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	OR52Z1	P0C646	297 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	RARA	P10276	462 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	CYP2D6	P10635	497 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ALAD	P13716	330 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	PTK2	Q05397	1052 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	GRB10	Q13322	594 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PLP1-223	ENST00000621218	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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