RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.07□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 A6NNZ2 444 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TPP1O14773 563 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SGSM2O43147 1006 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 UPP2O95045 317 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 IL33O95760 270 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 HRGP04196 525 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 HOXD10P28358 340 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 GRK4P32298 578 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 IKBKEQ14164 716 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 LONRF1Q17RB8 773 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 PARP10Q53GL7 1025 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 MSL1Q68DK7 614 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 KRT77Q7Z794 578 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 IL17REQ8NFR9 667 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ANKRD7Q92527 254 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 RSAD1Q9HA92 442 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 VAMP4O75379 141 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 PPM1BO75688 479 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 MTA2O94776 668 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ZBED1O96006 694 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TGFB3P10600 412 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 AKAP5P24588 427 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 HTRA3P83110 453 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 OCRLQ01968 901 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SCARF1Q14162 830 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC93Q567U6 631 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 HHATQ5VTY9 493 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TTC30AQ86WT1 665 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TCP11Q8WWU5 503 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 GOLGA1Q92805 767 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 BICD1Q96G01 975 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 C1orf159Q96HA4 380 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SGCZQ96LD1 299 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TBATAQ96M53 351 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 IWS1Q96ST2 819 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 PANK2Q9BZ23 570 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 EXOC1Q9NV70 894 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 WHRNQ9P202 907 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 FNIP2Q9P278 1114 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 POLG2Q9UHN1 485 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 IQGAP2Q13576 1575 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 DYTNA2CJ06 578 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 PRSS47A8MTI9 375 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 GAS7O60861 476 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SMC2O95347 1197 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 GPSM2P81274 684 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 PCSK7Q16549 785 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 DCAF15Q66K64 600 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 STYK1Q6J9G0 422 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 SKAP1Q86WV1 359 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A1-211ENST00000612161 FAM13CQ8NE31 585 aa7.05□□□□□ -1.28
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