RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606455.5

MEIS1-217, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene MEIS1, Length 564 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-217ENST00000606455 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 ETNPPLQ8TBG4 499 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 SEPT1Q8WYJ6 367 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 PCYT2Q99447 389 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 SDF4Q9BRK5 362 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 TBC1D22BQ9NU19 505 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-217ENST00000606455 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 H3BRB1 525 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 B4GALT4O60513 344 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 LGR5O75473 907 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ITGB8P26012 769 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 MFSD10Q14728 455 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 B3GNT9Q6UX72 402 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ABHD15Q6UXT9 468 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SESTD1Q86VW0 696 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TRIM50Q86XT4 487 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 HAS1Q92839 578 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 RIT2Q99578 217 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 KIF3AQ9Y496 699 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 MROH7Q68CQ1 1323 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 EMSYQ7Z589 1322 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ABCB7O75027 752 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 CLTBP09497 229 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SYN1P17600 705 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 HOXC8P31273 242 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 CHMP4BP1P59074 171 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 LRCH2Q5VUJ6 765 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 KATNAL1Q9BW62 490 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 UNC45AQ9H3U1 944 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TBX21Q9UL17 535 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 LAMA3Q16787 3333 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 KIAA0355O15063 1070 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TBX3O15119 743 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 GAS7O60861 476 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ATP4AP20648 1035 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 KRT76Q01546 638 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 AFAP1L1Q8TED9 768 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 FAM20AQ96MK3 541 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 MTMR9Q96QG7 549 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 VAV3Q9UKW4 847 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 KAT6AQ92794 2004 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 H3BQV1 296 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TLR3O15455 904 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SYT1P21579 422 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 STAT5BP51692 787 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ADAM17P78536 824 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 NBR1Q14596 966 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 FAM47CQ5HY64 1035 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 SWSAP1Q6NVH7 229 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 HSCBQ8IWL3 235 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 C7orf31Q8N865 590 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 GLG1Q92896 1179 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TEKT3Q9BXF9 490 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 PRO3102Q9H379 93 aa10.67□□□□□ -0.7
MEIS1-217ENST00000606455 ERAP1Q9NZ08 941 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms