RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 TTC38Q5R3I4 469 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC174Q6PII3 467 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 FERMT3Q86UX7 667 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 AK8Q96MA6 479 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PQ27 194 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PQ64 194 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PQD8 194 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 M0R2N6 131 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 SPTLC2O15270 562 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CYP3A4P08684 503 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 FCER1AP12319 257 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ALAS1P13196 640 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CYP3A7P24462 503 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF76P36508 570 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ME1P48163 572 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 TM4SF4P48230 202 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 HSD17B4P51659 736 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PLS1Q14651 629 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 USH1GQ495M9 461 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 MOB2Q70IA6 237 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CPXCR1Q8N123 301 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 COA7Q96BR5 231 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ATG4CQ96DT6 458 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 FAM20AQ96MK3 541 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 RNF146Q9NTX7 359 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 USP25Q9UHP3 1055 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PTPRFP10586 1907 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 RASSF10A6NK89 507 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 BTBD19C9JJ37 291 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CA12O43570 354 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 NEMFO60524 1076 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CUTAO60888 179 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CFBP00751 764 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 HOXC6P09630 235 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CIITAP33076 1130 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 SREBF1P36956 1147 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PDIA5Q14554 519 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 KIF22Q14807 665 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 GNPTABQ3T906 1256 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 TREML2Q5T2D2 321 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 ADALQ6DHV7 355 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 KANK3Q6NY19 840 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 NLRX1Q86UT6 975 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 TNFRSF25Q93038 417 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 AIFM3Q96NN9 605 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 OTOFQ9HC10 1997 aa8.28□□□□□ -1.08
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PRU2 124 aa8.27□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 ASB14A6NK59 587 aa8.27□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 MEIS2O14770 477 aa8.27□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 CTAGE5O15320 804 aa8.27□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms