RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.034e-8■■■■■ 33.1
GIPC1-210ENST00000589497 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 LARGE1O95461 756 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 CTDNEP1O95476 244 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 RFC2P35250 354 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TBCKQ8TEA7 893 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 UIMC1Q96RL1 719 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 DTNBO60941 627 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 IQCF3P0C7M6 154 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ACTN1P12814 892 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 MARK3P27448 753 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ACTR2P61160 394 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM240Q5SV17 173 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SETD4Q9NVD3 440 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 BACH1O14867 736 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ST18O60284 1047 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 PFKMP08237 780 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SELPP16109 830 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 CIITAP33076 1130 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 RABEP1Q15276 862 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ZBBXA8MT70 800 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 THPOP40225 353 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 STAT5BP51692 787 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SAMM50Q9Y512 469 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 NRCAMQ92823 1304 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 CKBP12277 381 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 PPFIA1Q13136 1202 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 GPR153Q6NV75 609 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 TRPC6Q9Y210 931 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 EMSYQ7Z589 1322 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 TREHO43280 583 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 JAK2O60674 1132 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 KRT2P35908 639 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 FOSBP53539 338 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 KRT76Q01546 638 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 INF2Q27J81 1249 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SERINC5Q86VE9 423 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 HERVK_113Q902F9 699 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 KIF2CQ99661 725 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 M0R2N6 131 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 MARCH6O60337 910 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 GAS7O60861 476 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 LGR5O75473 907 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SLC26A2P50443 739 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 IGBP1P78318 339 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 HIC1Q14526 733 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 LETM2Q2VYF4 491 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 IL27Q8NEV9 243 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF302Q9NR11 478 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-210ENST00000589497 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-210ENST00000589497 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-210ENST00000589497 MSH4O15457 936 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-210ENST00000589497 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-210ENST00000589497 ATG7O95352 703 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms