RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	ARHGAP4	P98171	946 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	NRCAM	Q92823	1304 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	ARHGEF15	O94989	841 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	GJB5	O95377	273 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	ADCY7	P51828	1080 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	RCAN1	P53805	252 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	FUT2	Q10981	343 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	RAD9A	Q99638	391 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	CTSH	P09668	335 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	KAT6A	Q92794	2004 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	SEPT8	Q92599	483 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	GLG1	Q92896	1179 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	LCHN	A4D1U4	455 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	SMCO2	A6NFE2	343 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	EPOP	A6NHQ4	379 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	AMH	P03971	560 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	ADAM17	P78536	824 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	BARHL2	Q9NY43	387 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	STXBP3	O00186	592 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	CDC27	P30260	824 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	32.57	■■■□□ 2.8	9e-7	■■■□□ 19
GPS1-225	ENST00000585084	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	KCNB2	Q92953	911 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	PGBD1	Q96JS3	809 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	VCAN	P13611	3396 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	CPA1	P15085	419 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	HSPA4	P34932	840 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	PPFIA1	Q13136	1202 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084		Q6ZUG5	572 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	ANO3	Q9BYT9	981 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	MARK3	P27448	753 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	APOBR	Q0VD83	1088 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	AP3B2	Q13367	1082 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	ASB2	Q96Q27	587 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	SDF4	Q9BRK5	362 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		32.54	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	BRF1	Q92994	677 aa		32.54	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	INSL6	Q9Y581	213 aa		32.54	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	REC8	O95072	547 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	GRB10	Q13322	594 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	GRIK4	Q16099	956 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	CEP55	Q53EZ4	464 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	FAM26D	Q5JW98	314 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	SPRED2	Q7Z698	418 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	RSPH3	Q86UC2	560 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	IL27	Q8NEV9	243 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	AZI2	Q9H6S1	392 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF76	P36508	570 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	APBB2	Q92870	758 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM260	Q9NX78	707 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	NFASC	O94856	1347 aa		32.51	■■■□□ 2.8
GPS1-225	ENST00000585084	LINC01553	A4QN01	128 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	KRT40	Q6A162	431 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	TTC28	Q96AY4	2481 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	AR	P10275	920 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	SCG2	P13521	617 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	PSMA5	P28066	241 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	SREBF1	P36956	1147 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	ERVK-21	P61565	698 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	RPAIN	Q86UA6	219 aa		32.5	■■■□□ 2.79

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