RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	TRAPPC10	P48553	1259 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	RGS19	P49795	217 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	RTP1	P59025	263 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ITGA7	Q13683	1181 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	GLG1	Q92896	1179 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	RIT2	Q99578	217 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	BACH1	O14867	736 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	CCNE2	O96020	404 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	PSEN2	P49810	448 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	MFSD10	Q14728	455 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM60	Q495X7	471 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	AZI2	Q9H6S1	392 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	EVI5	O60447	810 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	BRAP	Q7Z569	592 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	FAM20A	Q96MK3	541 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	MTMR6	Q9Y217	621 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229		H3BRB1	525 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	TBX3	O15119	743 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	F2	P00734	622 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	MARK3	P27448	753 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	KAT2B	Q92831	832 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	WDR64	B1ANS9	1081 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	ARVCF	O00192	962 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PSMD10	O75832	226 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf31	Q8N865	590 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	HAS1	Q92839	578 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PSAP	P07602	524 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TXK	P42681	527 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	DISC1	Q9NRI5	854 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	EMSY	Q7Z589	1322 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	OR52Z1	P0C646	297 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	JAK3	P52333	1124 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	REST	Q13127	1097 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	SNX17	Q15036	470 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF302	Q9NR11	478 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	GRIN2D	O15399	1336 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	SFN	P31947	248 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TLE2	Q04725	743 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	STAT5B	P51692	787 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	VAV3	Q9UKW4	847 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	TRPC6	Q9Y210	931 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	NOD1	Q9Y239	953 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	LGR5	O75473	907 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	ATG7	O95352	703 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PTGDR	Q13258	359 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	PCYT2	Q99447	389 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-223	ENST00000584229	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		28.07	■■■□□ 2.08

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