RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM82A0PJX8 343 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ALG1L2C9J202 215 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TGFB1P01137 390 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 IGHA1P01876 353 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PRKCQQ04759 706 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MSMPQ1L6U9 139 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 STYK1Q6J9G0 422 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 VAV3Q9UKW4 847 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 AQP7O14520 342 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 GSTM1P09488 218 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 IGFALSP35858 605 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TEKQ02763 1124 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CREG2Q8IUH2 290 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 DCAF4Q8WV16 495 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 B4E1Z4 1266 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PLS3P13797 630 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 NAT1P18440 290 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 SEPHS1P49903 392 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ODR4Q5SWX8 454 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC103Q8IW40 242 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ASB11Q8WXH4 323 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 SCLYQ96I15 445 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC1BQ9P126 229 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 NRAPQ86VF7 1730 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 USP19O94966 1318 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC7Q96M83 1385 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 KPNA6O60684 536 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FKTNO75072 461 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 NPTXRO95502 500 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FURINP09958 794 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-208ENST00000578600 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 EGR3Q06889 387 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 STRN3Q13033 797 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF460Q14592 562 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 AOC3Q16853 763 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP100Q494V2 611 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 KSR1Q8IVT5 923 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 JDP2Q8WYK2 163 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MISP3Q96FF7 219 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MMP19Q99542 508 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ACEP12821 1306 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PPLO60437 1756 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 RASGRP1O95267 797 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CRTAMO95727 393 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 JMJD7P0C870 316 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 GUCY1A3Q02108 690 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ZPBP2Q6X784 338 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRM-208ENST00000578600 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CDK19Q9BWU1 502 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 GPR27Q9NS67 375 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 RREB1Q92766 1687 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 PAMP19021 973 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 ITGB7P26010 798 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 LTBRP36941 435 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
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