RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BBS2-215	ENST00000566452	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BBS2-215	ENST00000566452	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BBS2-215	ENST00000566452	FANCA	O15360	1455 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BBS2-215	ENST00000566452	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	IL33	O95760	270 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ASGR2	P07307	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	HSPA6	P17066	643 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RAB6A	P20340	208 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NEK3	P51956	506 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ST5	P78524	1137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DIO2	Q92813	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	C3	P01024	1663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452		H7C1D1	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MEIS1	O00470	390 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NRDC	O43847	1150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SOD2	P04179	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DNM2	P50570	870 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GRM3	Q14832	879 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ABCA8	O94911	1581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MYO1B	O43795	1136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MSC	O60682	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	LRRN2	O75325	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PAPLN	O95428	1278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PLS3	P13797	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	IFNGR1	P15260	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GRK2	P25098	689 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	BMP8B	P34820	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GRK3	P35626	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CTSK	P43235	329 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	USP11	P51784	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GJA9	P57773	515 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PHC1	P78364	1004 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	LRRC32	Q14392	662 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	BROX	Q5VW32	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67

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