RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 A0A1B0GVL5 298 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 EML1O00423 815 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 PTMSP20962 102 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 TNFAIP2Q03169 654 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTU2-204ENST00000564105 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 TRPV1Q8NER1 839 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 SMPD1P17405 629 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 GRK4P32298 578 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 UBA7P41226 1012 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 SP4Q02446 784 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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CTU2-204ENST00000564105 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 SAMM50Q9Y512 469 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 EVPLQ92817 2033 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 CCNE2O96020 404 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 GH1P01241 217 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 SFNP31947 248 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 TXLNAP40222 546 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 JAK3P52333 1124 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 KRT79Q5XKE5 535 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 CABP7Q86V35 215 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 ERMNQ8TAM6 284 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 DISC1Q9NRI5 854 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 STK24Q9Y6E0 443 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 POTEFA5A3E0 1075 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 WDR64B1ANS9 1081 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 ADCY6O43306 1168 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 AKR1A1P14550 325 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 PFKFB1P16118 471 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 PTGS1P23219 599 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 EPHA7Q15375 998 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 ARMC5Q96C12 935 aa21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTU2-204ENST00000564105 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 CNGA1P29973 690 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 ACTR2P61160 394 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP1Q07960 439 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 LAMC2Q13753 1193 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 RDM1Q8NG50 284 aa21.51■■□□□ 1.03
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CTU2-204ENST00000564105 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTU2-204ENST00000564105 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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CTU2-204ENST00000564105 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.5■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 CALML4Q96GE6 196 aa21.5■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 SPATA33Q96N06 139 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTU2-204ENST00000564105 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.5■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 SEPT4O43236 478 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 LIG1P18858 919 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 PDILTQ8N807 584 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 GPT2Q8TD30 523 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 DYDC2Q96IM9 177 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 PANK2Q9BZ23 570 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 MED24O75448 989 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 ATG7O95352 703 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 PSAPP07602 524 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 RPA1P27694 616 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 SYKP43405 635 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 CYP4A11Q02928 519 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 TLK2Q86UE8 772 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 NEK9Q8TD19 979 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 GPR20Q99678 358 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-204ENST00000564105 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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